1、遗传改良和遗传资源的保护

2、海产动物繁殖和养殖新技术、新模式研发与应用

3、养殖病害的研究

4、海产养殖动物营养与饲料的研究

5、养殖水环境调控和生态修复的研究

其中，2014年主要研究方向：

1、 海洋生物种质资源与重要性状遗传改良

② 海洋生物种质鉴定与保存

②海洋生物基因组学

③ 海洋生物育种理论与技术研究

④ 海水养殖生物新品种培育

2、 海水养殖生物疾病控制

② 海水养殖生物流行病学

② 海水养殖生物病原生物学

③ 海水养殖动物免疫学

④海水养殖生物疾病防控理论与技术

3、 海水健康养殖技术与生态渔业

② 海水增养殖的生物学与生态学基础

② 海水养殖动物营养与饲料

③ 苗种繁育、养殖模式与碳汇渔业